这是一个文明将被摧毁，灾难肆意横行的荒芜世界。一场毁灭式的核爆在阴谋的漩涡中诞生，格伦州一个位于亚特丽星球，与地球相似度高达百分之99 的星球已经变成了遍布辐射尘与哀嚎的蛮荒之地,而格伦州也成为唯一未被波及的区域，成为了亚特丽星球旧统治者与财阀重建的菁英区。而大多数遭到辐射污染与有着犯罪前科的人，被放逐到资源极少，环境恶劣、满受辐射尘所侵袭的废土荒漠上，成为了废土区，由此形成了格伦州界限分明的菁英区与废土区。

菁英区仍然是一个文明社会，有着自己的司法制度，基本的社会体系。而废土区是一个没有法律的荒漠，曾经一些被隔离出去并有着犯罪前科的人在这里变本加厉，在这个没有法律制约的土地上肆意妄为。虽然废土区已基本脱管于菁英区，但是副州长邵逸仍然对废土区实行为人民发放辐射清疫苗的政策，以防止废土区人民身体遭受辐射的疾病与病变。

原早在核爆将文明被摧毁前，副州长邵逸就已经策划这场爆炸，由于从小的生活环境与成长过程，让他对罪恶仇恨，所以他自小就痛恨罪恶，只是偏激而扭曲的心态，让他选择了一种错误的方式发动爆炸，来进行内心中对罪恶与美好的人群进行划分，而他利用了格伦州的新型武器合成钚引爆了格伦州…

而此过程中，邵逸杀害了自己同在安全局的特工施铭君，可没有想到的是，施铭君被姐姐施妍保住了性命，并且长达20年的时间长眠于地下防空洞。当施铭君苏醒发现自己记忆全失，仅剩下细微线索去探寻，于是施铭君追寻线索的同时，不仅发现了自己的身世与父亲姐姐被害的原因，格伦州被摧毁的内幕，还牵出邵逸所研制出的新型辐射清是进行二次纯净主义的目的与阴谋。

而命运捉弄人，施铭君在废土与邵岚结识（邵逸之女），施铭君与邵岚一同展开了一场追寻真相的旅途。施铭君曾是前格伦州安全局特工，被战友邵逸陷害，父亲也在拾穗者任务中被射杀。受伤后的施铭君被及时解救，却一直在防空洞中的地下冷冻氧舱进行休眠。核爆炸席卷后的格伦州面目全非，当施铭君再次睁眼看到一个全新的世界时，他失去了记忆，而他必须要找寻记忆，查清身份，洗脱冤屈，为父亲报仇……随之他在找寻自己身份线索的过程中，机缘巧合下与从菁英区独自跑去废土区的邵岚（菁英区副州长之女）相遇，两人搭伴完成各自的任务与使命，而巧合的是，这两件事都和当年格伦州高层的“拾穗者“计划的阴谋有关。

在施铭君的帮助下，邵岚前往极寒之地完成了朋友离别前托付给她的事情，并且发现自己了解到的阴谋，与施铭君当年所牵扯的事件有关。二人根据第一次在极寒之地找到的前格伦州安全局副局长甄妮留下的线索一步步推进，他们找到了20年前临进入冷冻舱前，施铭君受重伤时曾为他医治的医生住所，然而现在已经变成了一片RV车聚集地。在此地，他发现了身上的枪伤来源，但让他感到可耻的是，这片聚集地的医生周进是曾经救过他的医生之子，但如今做的却是器官交易生意。施铭君在找到子弹线索的同时，顺藤摸瓜地找到了上一层的主导者-简云鹏。接着他从简云鹏口中，得出了当年参与当年拾穗者计划的人中，有一名主使人是IRIK恐怖分子菲拉，还有一位，就是现格伦州州长欧阳虔……

一场飓风席卷鬼市后，废土贫民相继出现病症。原来菁英区发放在废土区的第二批辐射清中，有着置人于死地的元素。表面上看，这个元素并不具备任何危害，只有通过分传导，与长年以来种植在废土上的一种新型培育的散播在空气中的风媒花花粉结合，才会导致催化病变。当施铭君找到欧阳虔并将凶手嫌疑指向欧阳虔时，邵逸暗地用欧阳虔孩子的性命加以威胁，导致欧阳虔隐瞒了真相并饮弹自杀。与此同时，施铭君父亲的好友郑苑博（菁英区辐射清研发人）在与邵逸的聊天中无意发现邵逸在谈论当年“拾穗者”计划时有所隐瞒，并根据邵逸言语中的漏洞，推断出他即有可能在谋划着一个巨大的阴谋。

施铭君与副州长的女儿邵岚，发现了副州长邵逸的阴谋。与此同时，施铭君愈发觉得格伦州的毁灭与自己有关，最终找出了真正的凶手和疑团背后的真相——原来邵逸是施铭君在安全局的搭档，两人配合默契，身手相当，惺惺相惜，可没想到在“拾穗者”计划的营救任务中，施铭君发现自己奉命要营救的科学家，竟然是他以为早已死去的父亲，但这一切却遭到邵逸突如其来的背叛。邵逸同时射杀了施铭君和父亲方逊，方逊当场死亡。施铭君最终得知自己是执行并截获合成钚任务中的安全局特工，但在执行解救战友邵逸（早期也是安全局特工）和合成钚科学家方逊（自己的父亲）的任务中，被战友邵逸利用。他将施铭君杀死后，截获了合成钚，导致了格伦州的核爆…

原来邵逸作为当时欧阳虔所在特工局的特工，为欧阳虔执行任务，而欧阳虔与简云鹏合谋串通，二人为国难财而合谋，假借“拾穗者”救援计划失败让邵逸执行合成钚的引爆。而作为最直接的执行者邵逸，实际上在内心有一股畸形的“大义”，他要实现自己内心中的“纯净主义”，将亚特丽星球中，格伦州的“有罪之人”清除于格伦州，为此在任务执行中不惜杀掉自己的战友施铭君与其父亲。

核爆后的格伦州被重建，被命名为菁英区，邵逸也被欧阳虔提拔成了菁英区的副州长。为了提升自己的位置，邵逸参加菁英区州长的竞选，用“假死”的伎俩“干掉”欧阳虔后，成为了格伦州的州长。但邵逸的目的并不是为了名利，而是于此之上，实现更进一步的纯净主义。用自己培育出的风媒花花粉与新研制出的抗辐射药物进行废土区最常见的风传播进行催化，用以施行20年后第二次的“纯净主义”。当施铭君得知邵逸的阴谋与两人的恩怨后，二人展开了殊死一战……

菁英区的领导者仍然是当年格伦州的州长欧阳虔和副州长邵逸。邵逸提出的惠民政策（新辐射清的发放制度）占据很高的民心，此时也同样威胁到了欧阳虔的政治地位。而辐射清疫苗一直是废土和菁英区不可缺少的药物，此刻欧阳虔为了稳定自己的政治局势，开始投入全新的辐射清研究，他为了达到目的，命令自己在废土区的爪牙付云泰为他抓废土人民进行人体实验。

而人体实验工厂无意中被邵逸的手下Helen在废土区执行任务时发现，她所录下的证据交到了邵逸的手上。当欧阳虔得知邵岚在废土区时，他派人在废土区抓邵岚想以此和邵逸进行制衡，同时在州长竞选日对邵逸进行刺杀。邵逸在全剧的中心点第六集才透露出自己内心的阴暗，慢慢的展露出进行纯净主义的原因——童年残酷的经历和悲惨的身世遭遇，让他仇恨罪恶，自私自利。

邵逸通过对郑苑博的监控，发现废土区的一个地点藏有重要的信息，于是邵逸派Helen找到了密闭的防空洞。因为施铭君已在两天前离开了这里，Helen从这里采集到施铭君在氧舱中的身体数据信息。通过数据分析和对郑苑博的窃听信息，邵逸得知氧舱内走出的人体内，含有永久性抗辐射血清。随之邵逸开始对此人进行追查。他内心既渴望研制出永久辐射清拯救自己的病，也害怕自己的阴谋遭到暴露。

在与郑苑博的一次对话中，邵逸无意中聊到了当年在安全局接到“拾穗者”任务后，施铭君的背叛，并且杀害了当时的科学家方逊，由此郑苑博开始认定邵逸的虚伪。郑苑博与施铭君父亲曾是好友，早年因为施铭君父亲方逊在研究合成钚时被高层假装发布出他失踪的消息，施铭君母亲将施铭君和姐姐施妍的姓氏从方改成了施，这个秘密只有郑苑博知道。但邵逸在“拾穗者”任务中，并不知道原来方逊是施铭君的父亲，于是他的谎言暴露了自己的阴谋。郑苑博随之离开了菁英区，并且通过DNA验证，得出了施铭君没死的信息，最终和施铭君相见。