皖北大地亳州市是历史上神医华陀的故乡，也是中国四大药都之一，在这么块人杰地灵的大地上，古今历史上出现了不少名医高手及草药种植配制高人。本剧呈现的是亳州市利辛县籍近代名医侯宝璋少年时代在家乡随父学医以及得名医指点传授医学，而立志为乡亲父老行医祛病的故事。

少年时代的侯宝璋聪明好学，因随私熟先生及众学子野外观景吟诗作对时对答如流，又因以眼前景色出联难住先生，使私熟先生感到这个学生天资聪明，自已所授学业有限，因儿劝其另投他处求学新的知识。而侯宝璋的父亲因思想守旧，他误认为儿子侯宝璋年少轻狂，以小犯上而冒犯了私熟先生，因而被先生退学，为此他大怒，将侯宝璋绑在庭院拄上欲用家法责罚儿子，幸得疼爱孙子的爷爷了解详情后及时出面阻止解围，使得侯宝璋免于了一顿皮肉之苦。

带着对外面世界的憧憬，一心想走出利辛，外出闯世界求学的侯宝璋，在家人耽心他年少，且外面战乱而及力阻止反对之下，他不得不留在家中帮父亲在药铺打杂。

当嫉恶如仇的侯宝璋亲眼目睹了镇上恶霸为索赌债强抢少女进府抵债的场景时，他发誓要救出少女。为此，他与小伙伴用自制弹弓飞弹打伤欺负少女的恶霸，因而捅了马蜂窝，恶霸为此仗势要强占侯家药铺，在侯家人的苦苦相求下，恶霸逼着侯父不仅要摆酒赔罪，还得限期交上银钱赔偿他被弹弓损伤的医药营养费用。闯了大祸的侯宝璋再一次被父亲逮到，眼看着要遭受父亲一顿皮肉之苦的家法惩罚，幸得疼爱他的爷爷又一次出面解围。

在药铺帮父亲打杂的侯宝璋心地善良，他同情无钱买药治病的穷苦人，常常瞒着父亲偷偷拿着药草去接济穷苦乡邻。一次，他在畈野听到呼救声，在面对一位小伙伴落水的生死关头，他亳不犹豫地跳进河水中以自己学得的划水技艺将落水者救上岸，并利用从父亲那学到的落水急救方法及时挽救了小伙伴的生命。

因其有着一颗善良的心，胸怀大众，他常常将身上仅有的一些零花钱拿去接济贫病乡邻。因避灾荒战乱，一位它乡民间医术高人流落在街头行乞遭人驱赶时。侯宝璋出于同情，买了包子给这位医术高人解饥，这位饥饿乞讨的医术高人被侯宝璋小小年纪有着胸怀大众的同情心而深受感动。在得知侯父不懂治疗蛇伤而误被土匪绑入山寨逼迫医伤的情况时，看到年少的侯宝璋冒死欲闯山寨救父，在这危急时刻，这位医术高人及时站出来，为解救被困山寨的侯父与侯宝璋同闯山寨，给土匪头子治疗蛇伤。被医术高人医治好蛇伤的土匪头子良心发现，将侯父一行放下山去。

当侯家父子及力挽留这位医术高人加盟侯家药铺共同行医时，而这位高人谢绝了侯家父子的好意挽留，欲换地继续过着乞讨流浪的生活。临行前这位高人将随身所带的医书赠送给侯宝璋，侯宝璋以不占有他人财物而推辞，最终在医学高人再三肯求下，只得收下医书代为保管。

就在侯父被当地驻军留在军营治疗伤病员期间，家乡忽然霍乱流行，一些乡亲由于没得到及时治疗，而造成死亡，亲眼目睹儿时玩伴因霍乱夺去生命的侯宝璋，在生离死别的悲痛中改变了愿望，他发誓要好好学医去治病救死扶伤。他苦钻高人留下的医书知识，结合病人出现的病症及书上所标病理对症下药，他竟一举治好了乡亲们的病，很快使霍乱病在当地消失。因此，少年侯宝璋在家乡名声大震，被乡亲们称为奇医少年。一时间，方圆百里、甚至相邻的外省患者都慕名前来求医问药。

当恶霸为其患病儿子向侯宝璋求医时，趁此机会，他要求恶霸放回抵押赌债的少女，并销毁赌债凭证，使少女获得了自由。

侯宝璋日夜苦钻医书，为当地乡邻治好了不少患者的疑难杂症。利辛县城一财主夫人突然倒地不醒人事，请来几位当地郎中都无法医治，均认为夫人已死，就在财主欲给夫人操办丧事时，在家丁提醒下，财主半信半疑地请来侯宝璋医治，侯宝璋经诊断，发现夫人系卒死病症，当下进行救治，患者即刻苏醒过来。面对财主的重金酬谢，侯宝璋本着治病救人，医者仁心的宗旨，只是合理收取医疗费用，从不趁人之危诈取不义之财。使得其英名远播。

侯宝璋不仅有独到的医学技艺，而且为人机智。一日，当一位老人跛着腿上门求医时，看到父亲被老人所说病情难住，他在一旁通过仔细观察，发现该名老人所说病患是假，而是有意上门找茬，为此他灵机一动给老人端上一杯开水故意失手。使得该名老人当场假病露馅，并亮名了真实身份及上门的意图。

当侯宝璋了解到在其家乡附近传教的一位外国神父用西医给人看病疗伤，患者身体恢复较快时，他说服家人，下定决心要离开家乡去外面学习先进的医学知识，决定走中西医学结合，闯出一条为大众救死扶伤的新路。

侯宝璋告别家人，临离别生他养他的故土时，他对家乡深深一跪，用手帕包上家乡泥土，踏上了远去求学行医的道路。