江城市世风日下，人心不古。肥姐为首的黑恶势力团伙在有官员做为“保护伞”的条件下，非法涉足房地产开发等多种领域，从中谋取巨额利润，江城百姓怨声载道，苦不堪言。

面对江城市黑恶势力犯罪集团的严峻挑战，面对来自政界的黑势力集团保护伞的强大压力，公安局长贺飞组建了一支扫黑除恶的队伍，一张大网向江城市的黑恶势力慢慢张开……

冯军是一名充满正义感的刑警，在休息日偶然撞见肥姐黑势力团伙骨干之一的陈武行为可疑。为弄清楚陈武的目的，冯军说服和自己同样是刑警的发小丁一出面干涉，在追击陈武的过程中，冯军见到丁一死在陈武怀中。但几日后，陈武竟然无罪释放。而因自己而死的丁一居然被裁定行为失当，连因公殉职都算不上，这让冯军恼羞成怒，甚至和贺飞发生冲突，误会贺飞和肥姐集团勾结，以至被停职。

停职后的冯军，去医院探望了刚刚降生的丁一的遗腹子，看着孩子冯军更感对不起丁一一家，愈发坚定了将陈武绳之以法，帮丁一正名的决心。

若兰是冯军的警校同学，见冯军一意孤行，一直劝说冯军，效果甚微。在一次和冯军的晚饭中与黑势力成员发生冲突，后因黑势力成员的报复导致冯军和对方全部被带回警局。在若兰和秦队的帮助下，冯军才得以从看守所走出来。出来后的冯军，失去了警队的支持，只能单枪匹马与黑势力团伙纠缠。

面对冯军毫无章法的打击黑势力，团伙的老大肥姐终于决定要见一见这个横冲直撞的小警察。见到冯军拉拢未果之后，肥姐起了杀心……

在江边，由肥姐黑势力团伙中的骨干成员陈武和老鬼对冯军实施报复，原打算制服冯军后再伪造一个冯军因意外而死亡的现场。但因若兰的经过打乱了对方的部署，在阻止若兰搭救冯军未果之后，陈武和老鬼与若兰发生了激烈的冲突。最终以陈武将若兰从跨江大桥推下江而告终。此时冯军也在众黑势力成员的围攻下渐渐体力不支……

将若兰推下江后，陈武和老鬼驾车离开。途中陈武突然发难，将老鬼赶下车，老鬼不解，偷偷跟踪陈武。发现陈武返回江边，救起落水的若兰。原来陈武竟然是若兰的父亲，是贺飞安插在肥姐黑势力集团的一名卧底。悄悄通知肥姐后，老鬼在陈武走后绑架了若兰。

冯军在被黑势力成员制服后打昏过去，醒来之后发现自己险些被害，而意图加害自己的黑势力成员则倒在地上。冯军拨打若兰的电话始终打不通，担心若兰安慰的冯军，回到和若兰分手的江边，在询问目击者后，冯军得知若兰和黑势力发生冲突。于是走投无路的冯军只有求助在他眼里和肥姐集团同流合污的贺飞。

贺飞得知若兰可能遇险后，主动联系了肥姐，一番唇剑舌枪后，贺飞没有达到解救若兰的目的。此时贺飞面对冯军的质问，选择了将整个“曼陀罗”行动的计划——包括：陈武卧底、对肥姐黑势力团伙的搜证计划等对冯军和盘托出。

冯军见到陈武后愕然，在陈武对冯军说明之前的林林总总的事件真相后，冯军恍然。此时，曼陀罗计划可以收网，但由于肥姐的身份，需要时间去申请逮捕令。但此时肥姐已经对陈武的身份起疑，更是要求陈武前去和美米业见自己。若是陈武借故不去，肥姐必然警觉选择出逃，一旦出逃，则再欲抓捕难如登天。但若是陈武前去，虽可暂时稳住肥姐，但陈武的人身安全已经很难保证。两难之间，陈武毅然说服众人，只身前往。

此时，贺飞在陈武和冯军的分析下，精准的定位了若兰的位置并派出特警营救，同一时间申请下肥姐的逮捕令，将肥姐的违法场所同时查封，并将团伙中的骨干逮捕。

同一时间，冯军紧跟着陈武闯入和美米业，阻止了肥姐逃跑的举动。

与此同时，在市政府的大会上，贺飞和常务副市长姜子强汇报了抓捕肥姐的行动。姜子强震怒，原来他才是肥姐黑势力集团的真正保护伞。见肥姐大势已去，姜子强强行接过了抓捕现场的指挥权，欲击毙肥姐灭口，在狙击手接到姜子强的指令后，扣动扳机时，姜子强一颗悬着的心放了下来。

在会议结束后，姜子强装模作样的教训了贺飞之后，起身欲走，谁知被市委书记带人堵在会议室，要对其进行抓捕。姜子强仗着肥姐已死，无人可以指证自己，嚣张反驳。此时肥姐、老鬼等人在冯军和若兰的押解下走了过来，原来，现场贺飞已经提前部署过，狙击手只是打掉了妄图自杀的肥姐手中的手枪。姜子强哑口无言，束手就擒。

冯军、若兰、陈武、贺飞走在走廊上，陈武完成任务，光荣退休。冯军红着脸想要加入一开始自己看不上的扫黑小组，众人欣慰的笑了。从此冯军接过前辈的衣钵，继续奋斗在扫黑除恶的第一线，为江城人民能有一片更晴朗的天空努力着……