天武年间，不少山间修行的妖物偷偷潜入人间作乱，百姓不胜其扰。天武朝成立了新的“平妖门”，专门选拔身怀绝技的斩妖卫，来对付妖物作乱。

生活在鹤鸣山中小村的李兴元，和母亲相依为命，父亲早在他出生前便去世。母亲盼着他以后能去镇上饭馆或当铺、铁匠铺当个学徒，学个手艺，但李兴元从小活泼好动，喜欢搞一些小发明，母亲只能叹气。

李兴元喜欢和村里疯疯癫癫的怪老头老铁混在一起，老铁没事总传授他一些中医药知识。一日李兴元在后山采药，偶遇一受伤女子小灵，便带了回来，让老铁帮她疗伤，小灵住在了李兴元家，两人开始熟络起来。

那边，妖界有异动，青狼妖王正密谋唤醒神器赤铜残卷的力量，来一统妖界。谁料身边贴身侍卫蛇灵偷走赤铜残卷，逃走后下落不明。青狼妖王令属下秘密寻找，不料走漏了风声，妖界都知道赤铜残卷的威力，也都暗中寻找蛇灵的下落。

与此同时，平妖门从之前捉拿的一名妖界囚犯口中得知了有关蛇灵的信息，同时判断出传说中蛇灵逃往燕北山，是个假信息，真实情况是她应该逃往鹤鸣山一带，去寻找早些年隐居在人间的自己的姐姐金蛇精。派出平妖门斩妖卫顾梦然立即启程，欲赶在其他药物和青狼妖王之前找到蛇灵和赤铜残卷。

此时，化身为小灵的蛇灵，已在鹤鸣山里生活了一段时间，对李兴元渐生情愫。她暗中找到姐姐金蛇精，两妖欲将赤铜残卷毁掉或藏起，不让青狼妖王为害人间。哪知两人施法，却无法毁掉赤铜残卷。此时李兴元意外闯入，两妖尽力遮掩一番不让他起疑心，但同时赤铜残卷的信息也已外泄，妖界不少人感知到后立即赶来。

李兴元被小灵糊弄一番后返回，半路被疯老头老铁叫住。老铁说他近日犯了妖祟，拿给他一张符咒要他贴在家里。李兴元摸不着头脑地返回。

来找李兴元的小灵，一进屋就受到符咒侵袭。小灵正和符咒斗法，李兴元则被吓得大惊失色，此时老铁闯入，和小灵斗在一起，扬言要收了小灵。李兴元想要保护小灵，老铁投鼠忌器，未能将小灵捉拿，反被小灵制住。

李兴元向小灵求情让她放了老铁，此时方知老铁原来是600年前周天师的嫡传弟子。周天师封印了斩妖剑，并留下谶语，称10个甲子过后，将由新的执剑人执掌斩妖剑，维护人间正义，镇压妖物作乱。小灵和老铁争执起来，又要动手，恰逢斩妖卫顾梦然，以及青狼妖王手下赶到。

混战发生，老铁发现周天师所传法力误中李兴元身上，竟然对其不起作用，方知李兴元可能就是周天师口中的执剑人。此时激战中，小灵被妖物掳走，老铁被妖物打伤，临死前告知众人：毁赤铜残卷，降服青狼妖王，必由执剑人即李兴元来完成。但此时李兴元还未完成历练，斩妖剑还未认主。

李兴元为了找到心爱的小灵，和顾梦然一起赴青城谷寻青狼妖王。

赶路赶到一半，在一家客栈歇息。李兴元半夜起床见一个神似小灵的身影，被吸引了出去，却不知乃是想吸他阳气的魅魔。魅魔幻化成小灵的样子对李兴元一番诱惑，关键时刻顾梦兰现身，赶走魅魔。顾梦然叮嘱李兴元：要成为守卫人间太平的执剑人，还要经历不少历练。

李兴元和顾梦然乔装打扮潜入青城谷，混在一众妖物中间。恰好赶上了青狼妖王公开处决叛徒小灵。见小灵被押上来，李兴元急得立刻要冲出去搭救，被顾梦兰制止，欲静观其变。

果然，从青狼妖王和小灵的话语中，顾梦然得知小灵并未交出宝物赤铜残卷，反倒令青狼妖王束手无策，威逼利诱很久无果，便打算将小灵处决。

顾梦然脱去伪装，亮出降妖法宝，令青狼妖王措手不及，连忙出手，两人斗在一起，其他妖物作鸟兽散。

顾梦兰这次出手，一方面为解小灵之围，一方面也是打草惊蛇、声东击西之计。她很快摆脱了妖王的追击，赶回来和李兴元汇合，二人打算晚间去营救小灵，让小灵带他们找到赤铜残卷，用其力量降服妖王。

半夜，李兴元和顾梦然寻找妖王府的牢房，却意外得知一个新消息：青狼妖王改变了策略，他打算将小灵即蛇灵娶为妾室，许诺二人共享荣华富贵。得知后李兴元更加着急，赶紧寻到了妖王卧房。

刚到，便见妖王气呼呼离开。李兴元告知顾梦然：自己此时可以进去劝说小灵，拿出赤铜残卷降服青狼妖王，只要顾梦然和平妖门可以放小灵一条生路，与自己回家过平凡的日子。顾梦然答应。

李兴元魔金屋，见到刚和妖王争执完的小灵。重逢的两人喜极而泣，刚准备逃走，青狼妖王去而复返，将二人捉拿。原来狡猾的青狼妖王早有准备，意图将执剑人李兴元消灭，同时顾梦然也落入妖王布置好的陷阱。

青狼妖王在法坛公开处决三人，逼迫小灵说出赤铜残卷的下落，否则李兴元性命不保。小灵知道自己即便拿出赤铜残卷，妖王也不会放过将成为威胁的李兴元，故而一直不松口。青狼妖王恼羞成怒，欲杀李兴元而后快。

千钧一发之际，其他三名斩妖卫赶到，阻断了青狼妖王。小灵也唤出了赤铜残卷——原来赤铜残卷一直在她身上，由姐姐金蛇精用法力化身七宝盒保存住——两姐妹集中法力，终于成功将赤铜残卷毁掉，而小灵自身也油尽灯枯，死在李兴元怀里。

赤铜残卷已毁，愤怒的青狼妖王欲将所有人杀掉。悲痛欲绝的李兴元终于得到点化，成功化身执剑人，用斩妖剑将青狼妖王除掉。

小灵已逝，留给李兴元的仅剩哀思。青城谷众妖承诺再不扰乱人间。李兴元从此背负起了责任，加入了平妖门，成为一名斩妖卫。